718712 Biodegradation (2 Kurse)

Wintersemester 2014/2015 | Stand: 04.12.2015 LV auf Merkliste setzen
Institut für Mikrobiologie Institut für Mikrobiologie
Marina Fernández-Delgado Juárez, MSc PhD Marina Fernández-Delgado Juárez, MSc PhD
Priv.-Doz. Dr. Ingrid Franke-Whittle Priv.-Doz. Dr. Ingrid Franke-Whittle
Dr. Maria Gomez-Brandon Dr. Maria Gomez-Brandon
718712
Biodegradation (2 Kurse)
UE 3
4,5
Block
jährlich
Deutsch

Selbstständigkeit im Labor. Team-Arbeit. Verglichung von ÖNORM-standarisierten und molecular und physiologischen Methoden um die Abbaubarkeit von Biopolymere und Pestiziden testen. Kritische Diskussion der Ergebnisse.

In diesem Praktikum, das sowohl Mikrobiologen als auch Ökologen ansprechen soll, werden Methoden vorgestellt, mit denen mikrobiologische Funktionen in Ökosystemen und im Recyclingbereich untersucht werden. Dabei werden Tests zur Beurteilung der Abbaubarkeit von organischen Materialien durchgeführt und der mikrobielle Abbau des als Unkrautbekämpfungsmittel verwendeten Wirkstoffs Glyphosat analysiert. Die an diesem Degradationsprozess beteiligten Mikroorganismen werden mittels molekularbiologischer Methoden charakterisiert (PCR, Microarray).
Labor, Kleingruppenrunden

Eingangstest                   10%

Mitarbeit                          25%

Abschlusspräsentation    25%

Laborprotokoll                 40%

Campbell CD, Chapman J, Cameron CM, Davidson MS, Potts JM (2003) A rapid microtiter plate method to measure carbon dioxide evolved from carbon substrate amendments so as to determine the physiological profiles of soil microbial communities by using whole soil. Applied and Environmental Microbiology 69, 3593-3599

Balthazor TM, Hallas LE (1986) Glyphosate-Degrading Microorganisms from Industrial Activated Sludge. Applied and Environmental Microbiology 51, 432-434

Foster JW, Davis RH (1966) A Methane-Dependent Coccus, with Notes on Classification and Nomenclature of Obligate, Methane-Utilizing Bacteria. Journal of Bacteriology 91, 1924-1931

Bodrossy, L., Sessitsch, A., 2004. Oligonucleotide microarrays in microbial diagnostics. Curr. Opin. Microbiol. 7, 246-255.

 

Bodrossy, L., Stralis-Pavese, N., Murrell, J.C., Radajewski, S., Weilharter, A., Sessitsch, A., 2003. Development and validation of a diagnostic microbial microarray for methanotrophs. Environ. Microbiol. 5, 566-582.

 

Franke-Whittle IH, Knapp BA, Fuchs J, Kaufmann R, Insam H (2009) Application of COMPOCHIP microarray to investigate the bacterial communities of different composts. Microbial Ecology 57, 510–521.

 

Loy A, Lehner A, Lee N, Adamczyk J, Meier H, Ernst J, Schleifer KH, Wagner M (2002) Oligonucleotide microarray for 16S rRNA gene-based detection of all recognized lineages of sulfate-reducing prokaryotes in the environment. Applied and Environmental Microbiology 68, 5064-5081.

 

Peplies, J., Oliver Glockner, F., Amann, R., 2003. Optimization strategies for DNA microarray-based detection of bacteria with 16S rRNA-targeting oligonucleotide probes.  Appl. Environ. Microbiol. 69, 1397-1407.

 

ASTM - Standard 5247 (1992) Determining the aerobic biodegradation of degradable plastics by specific microorganisms

 

ASTM - Standard 5209 (1992) Determining the aerobic biodegradation of degradable plastics in the presence of municipal sewage sludge

 

 

 

Masters Studium 830

wichtig: Einteilung bei der Vorbesprechung zu Semesterbegin

https://lms.uibk.ac.at/url/RepositoryEntry/3749609797
13.10.2014