724063 Computersimulationen
Sommersemester 2006 | Stand: 12.07.2006 | LV auf Merkliste setzen724063
Computersimulationen
VO 2
wöch.
jährlich
Deutsch
In der Vorlesung werden Methoden zur Beschreibung von Molekülen vor allem in der flüssigen Phase – beispielsweise durch Beobachtung der zeitlichen Entwicklung von Systemen – diskutiert. Anwendungen zur Berechnung thermodynamischer Zustandsgrößen, zur Vorhersage struktureller und dynamischer Eigenschaften von Lösungen und zur Konformationsvorhersage von Biomolekülen – beispielsweise in Kombination mit NMR Daten – werden besprochen.
Grundkonzepte
· Wahrscheinlichkeiten
· Ergoden Hypothese
· Molecular Dynamics und Monte-Carlo
· Fundamentale Eigenschaften
Allgemeine Vorgangsweise
· Grundvoraussetzungen
· Randbedingungen
· Equilibrierung
· Cutoff für Potentiale
· Elektrostatische Wechselwirkungen
Molecular Dynamics
· Euler Verfahren
· Integrationsverfahren höherer Ordnung
· Größe des Zeitschritts
· Constrained Dynamics
· Zeitabhängige Eigenschaften
· Kanonisches und NPT Ensemble
· Restrained Dynamics (NMR)
· Berechnung der freien Energie
Monte-Carlo Integrationen
· Separation des Phasenraums
· Integration im Konfigurationsraum
· Der Metropolis-Algorithmus
· Die Bewegung von Molekülen
8. Semester
Beginn: bitte Klaus.Liedl@uibk.ac.at kontaktieren
Beginn: bitte Klaus.Liedl@uibk.ac.at kontaktieren
9:15-10:45, SR 215
- Fakultät für Chemie und Pharmazie