718767 UE Struktur und Funktion von Mikrobiomen
Sommersemester 2019 | Stand: 22.10.2021 | LV auf Merkliste setzenDipl.-Biol. Maraike Probst, PhD Dipl.-Biol. Maraike Probst, PhD, +43 512 507 51325
Die Studierenden lernen ausgewählte Methoden zur Untersuchung von Mikrobiomen kennen.
Verschiedene Standorte (Grasland, Waldboden, Sumpf) werden in Hinblick auf Zusammensetzung und Aktivität der mikrobiellen Gemeinschaften untersucht (qPCR, NGS-Datenanalyse). Zusätzlich werden physikalisch-chemische und biologische Bodenparameter erfasst und in Verbindung mit den Sequenzdaten statistisch ausgewertet.
Praktische Übung im Labor und am Computer
Labor: DNA-Extraktion, DNA-Quantifizierung, qPCR, Bodenchemie
Computer: NGS Datenanalyse (Illumina MiSeq Datensatz) mit der CoMA Pipeline, Einführung in Statistiksoftware R; statistische Datenauswertung und Visualisierung
Immanenter Prüfungscharakter und Abschlussprojekt. Genauere Informationen folgen.
Material zu den Übungen wird rechtzeitig in OLAT bereitgestellt.
Der Kurs wird in virtuellem Modus abgehalten werden. Daher werden die jeweiligen Termine nicht geblockt stattfinden. Nach Absprache mit den Studierenden werden wir konkrete Termine ausmachen. Wir danken für Ihr Verständnis.
Im Seminar "Techniques in Microbial Ecology (LV-718766)" werden wichtige methodische Aspekte diskutiert; einne Teilnahme an diesem wird daher dringend empfohlen.
Die Anmeldungen erfolgen alle in Gruppe 0.
Online-Registrierung und Anwesenheit bei der Übungsvorbesprechung (auch in Vertretung) ist erforderlich.
Vorbesprechung am 04.03.2019 um 09:00 Uhr, HS E (Technik)
https://www.uibk.ac.at/microbiology/study-affairs/
Gruppe 0
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Hupfauf S., Probst M. | ||||
Datum | Uhrzeit | Ort | ||
Mo 04.03.2019
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13.15 - 17.00 | rr 19 rr 19 | Barrierefrei | |
Do 23.05.2019
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09.00 - 17.00 | rr 19 rr 19 | Barrierefrei | VO-Teil für beide Gruppen |
Fr 24.05.2019
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09.00 - 17.00 | rr 19 rr 19 | Barrierefrei | VO-Teil für beide Gruppen |
Sa 25.05.2019
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09.00 - 17.00 | HSB 5 HSB 5 | Barrierefrei | VO-Teil für beide Gruppen |
Mo 24.06.2019
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17.00 - 20.00 | SR 0/501 SR 0/501 | Barrierefrei | Nachbesprechung Praktikum |
Gruppe 1
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Hupfauf S., Probst M. | ||||
Datum | Uhrzeit | Ort | ||
Mo 13.05.2019
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09.00 - 17.00 | Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 | Barrierefrei | Übungsteil |
Di 14.05.2019
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09.00 - 17.00 | Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 | Barrierefrei | Übungsteil |
Mi 15.05.2019
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09.00 - 17.00 | Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 | Barrierefrei | Übungsteil |
Gruppe 2
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Hupfauf S., Probst M. | ||||
Datum | Uhrzeit | Ort | ||
Mo 13.05.2019
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09.00 - 17.00 | Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 | Barrierefrei | Übungsteil |
Di 14.05.2019
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09.00 - 17.00 | Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 | Barrierefrei | Übungsteil |
Mi 15.05.2019
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09.00 - 17.00 | Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 Mikrobiol. - Praktikumsraum 2-15 | Barrierefrei | Übungsteil |